Akademik Dersler - Tanıtım


Ders Kodu - Ders Adı	BİY471 - Moleküler Mikrobiyal Ekoloji
Ders Türü	Mesleki Seçmeli Dersler
Ders Dili	Türkçe
Teori + Uygulama	0+3
AKTS	5.0
Öğretim Elemanları	PROFESÖR DOKTOR MEHMET BURÇİN MUTLU
Dersin Veriliş Biçimi	Yüz yüze
Dersin Önkoşulları	Mikrobiyoloji I ve Mikrobiyoloji II derslerini almış olmak
Önerilen Dersler	-
Zorunlu ya da Önerilen Kaynaklar	Molecular Microbial Ecology Manual, Editors:G. A. Kowalchuk, F. J. Bruijn, I. M. Head, A. D. Akkermans, J. D. Elsas, Hardcover ISBN 978-1-4020-2176-3 Published: 09 August 2004, Springer Dordrecht
Okuma Listesi	Molecular Microbial Ecology (Osborn & Smith), Environmental Microbiology: From Genomes to Biogeochemistry (Eugene L. Madsen),
Değerlendirme	2 Ara Sınav, Ödev, Dönem Sonu Sınavı
Staj & Uygulama	-
Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları	Sağlık ve Kaliteli Yaşam , Nitelikli Eğitim , Temiz Su ve Sanitasyon

Haftalar	Konular
1. hafta	Mikrobiyal Ekolojiye Giriş: Tarihçe, temel kavramlar ve geleneksel yöntemlerin (kültürleme) sınırlamaları.
2. hafta	Mikroorganizmaların Çeşitliliği ve Filogenisi: Üç alem sistemi (Archaea, Bacteria, Eukarya) ve moleküler markörler (16S rRNA, 18S rRNA, ITS).
3. hafta	Çevresel Örneklerden Nükleik Asit Ekstraksiyonu: DNA ve RNA izolasyonu teknikleri, saflaştırma ve kalite kontrol süreçleri.
4. hafta	Nucleic Acid Extraction from Environmental Samples: DNA and RNA isolation techniques, purification and quality control processes.
5. hafta	Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) Temelli Yaklaşımlar: qPCR (kantitatif PCR), RT-PCR ve mikrobiyal parmak izi teknikleri (DGGE, T-RFLP)
6. hafta	Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) Temelli Yaklaşımlar: qPCR (kantitatif PCR), RT-PCR ve mikrobiyal parmak izi teknikleri (DGGE, T-RFLP)
7. hafta	Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) Temelli Yaklaşımlar: qPCR (kantitatif PCR), RT-PCR ve mikrobiyal parmak izi teknikleri (DGGE, T-RFLP)
8. hafta	Klon kütüphaneleri
9. hafta	Klon Kütüphaneleri
10. hafta	Fluoresan in situ hibridizasyon tekniği
11. hafta	DNA dizi analizi
12. hafta	DNA dizi analizi
13. hafta	Metagenomik
14. hafta	Metagenomik

Değerlendirme Yöntemi ve Geçme Kriterleri
	Sayısı	Yüzde (%)
Toplam (%)		0