Akademik Dersler - Tanıtım


Ders Kodu - Ders Adı	BİY431 - Biyoinformatiğe Giriş
Ders Türü	Mesleki Seçmeli Dersler
Ders Dili	Türkçe
Teori + Uygulama	2+0
AKTS	4.0
Öğretim Elemanları	PROFESÖR DOKTOR MUHİTTİN ARSLANYOLU
Dersin Veriliş Biçimi	Yüz yüze
Dersin Önkoşulları	Bu dersin ön koşulu yoktur.
Önerilen Dersler	Bu dersin tavsiye ettiği başka ders yoktur.
Zorunlu ya da Önerilen Kaynaklar	Dersin tavsiye ettiği bir kaynak kitap yoktur. Ders el notları, tercüme ve deneyim paylaşımı şeklinde anlatılmaktadır.
Okuma Listesi	Biyoinformatik teması içeren tüm kaynaklar bu ders için tavsiye edilir.
Değerlendirme	1 arasınav ve 1 final sınavı ile değerlendirme yapılır. Sınavlar bilgisayar ortamında veritabanları kullanılarak, klasik ve analitik yapıdadır.
Staj & Uygulama	Ders bilgisayar ortamında uygulamalı verilmektedir.
Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Haftalar	Konular
1. hafta	Biyoinformatiğe giriş
2. hafta	Moleküler Biyoloji'ye Kısa Giriş; DNA, RNA, Protein, Genom
3. hafta	Bilimsel araştırma yöntemleri ve gen klonlama
4. hafta	PCR, gen spesifik primer ve yarı-bozuk primer tasarımı
5. hafta	Gen Bankaları ve genel kullanımı
6. hafta	Gen Bankalarında DNA, RNA ve protein dizilerinin bulunması ve indirilmesi: BLAST programı
7. hafta	İnternet tabanlı programlar ile DNA, RNA ve protein dizilerinin analizi
8. hafta	Ara Sınav
9. hafta	Dikey dizi hizalama (ClustalX)
10. hafta	Yatay dizi hizalama ile örtüşen dizilerin bir araya getirilmesi
11. hafta	Tahmini protein yapı analizi
12. hafta	Filogenetik Analize giriş
13. hafta	Filogenetik Analiz
14. hafta	Genom veritabanları ve kullanımı

Değerlendirme Yöntemi ve Geçme Kriterleri
	Sayısı	Yüzde (%)
2.Ara Sınav	1	40
Dönem Sonu Sınavı	1	60
Toplam (%)		100